Der VDGS e.V. kooperiert mit zahlreichen übergeordneten nationalen und europäischen Branchen- und Dachverbänden und engagiert sich in deren Arbeitsgruppen:
In Deutschland
- AGF – Arbeitsgemeinschaft Getreideforschung e.V
- BVE – Bundesvereinigung der Ernährungsindustrie e.V.
- DGE – Deutsche Gesellschaft für Ernährung e.V.
- DMSB – Förderverein Deutsche Müllerschule Braunschweig e.V.
- FEI – Forschungskreis der Ernährungsindustrie e.V.
- FNR - Fachagentur Nachwachsende Rohstoffe e.V.
- FMIG – Food - Made in Germany e.V.
- Lebensmittelverband Deutschland e.V.
- VCI – Verband der chemischen Industrie e.V.
- VDM - Verband Deutscher Mühlen e.V.
- VDM - Verband Deutscher Mühlen e.V. - Initiative zur Müller-/Müllerinnen-Ausbildung
- VGMS - Verband der Getreide-, Mühlen- und Stärkewirtschaft VGMS e.V.
In Europa
- CEEREAL – Verband der europäischen Cerealienindustrie und Hafermühlen
- FERM – Vereinigung der europäischen Reismühlen
- FOODDRINKEUROPE – Verband der europäischen Lebensmittel- und Getränkeindustrie
- STARCH EUROPE – Verband der europäischen Stärkeindustrie
- SEMOULIERS - Vereinigung der europäischen Verbände der Hartweizenmühlen
- UN.A.F.P.A – Vereinigung der europäischen Verbände der Teigwarenhersteller